冷卻循環水水質是關鍵，對冷卻循環水進行處理分為物理法和化學法兩種。水冷冷水式冷水機冷卻系統一定要安裝電子水處理儀，或強磁水處理儀， 不然散熱效率衰減太大，使用時間越長，系統的效果越差，每年的水處理成本高，效果不可能達到 的除垢。
1、水冷/ 風冷冷水式冷凍機組均可以用在小系統上，大式冷凍機組絕大部分都是水冷的。 水冷初投資就主機而言 , 是比風冷的少一點。但加上冷卻塔和機房 \ 電子水處理儀等 , 也少不到什么地方去 ! 再說就長年運行來說 , 水冷式冷凍機組的制冷效率相對會下降，風冷下降很小。
2、水冷式冷凍機組須要對水質進行處理，否則將大幅度降低熱交換效率，造成能源的浪費，嚴重損壞制冷設備。對于開式冷卻循環水系統，由于冷卻水吸收熱量后，與空氣接觸， CO2逸入空氣中， 水中溶解氧和濁度增加， 造成冷卻循環水系統有 4 大問題： 污泥、腐蝕、結垢、菌藻滋生。因此，對水系統進行緩蝕、阻垢、殺菌滅藻處理是十分重要的。
